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作者簡介
目次
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《基因定位與育種設計》建立在作者十多年科研和教學的基礎之上，《基因定位與育種設計》可分為四部分. 第1章為第一部分，介紹遺傳研究群體. 主要包括常見群體類型、基因型數據的初步整理和分析、基因效應和遺傳方差的定義和計算、單環境和多環境表型觀測值的方差分析，以及基因型值和遺傳力的估計等內容. 第2章為第二部分，介紹連鎖分析和遺傳圖譜構建. 主要包括世代轉移矩陣、兩個座位上基因型的理論頻率、兩個基因座位間重組率的估算、作圖函數和遺傳圖譜構建算法等內容. 第3~第7章為第三部分，介紹數量性狀基因的作圖原理和方法. 主要包括單標記分析，簡單區間作圖，完備區間作圖，上位型互作及與環境互作的QTL作圖，選擇群體、自然群體和多親本群體的基因定位，以及QTL作圖中常見問題解析等內容. 第8~第10章為第四部分，介紹育種中的模擬、預測和設計. 主要包括育種過程的建模和模擬，育種方法的模擬比較和優化，線性預測模型及其育種應用，以及利用遺傳研究結果開展育種設計等內容. 前三部分可看作基因定位的內容，第四部分可看作育種設計的內容. 每章之后，附有練習題. 書后附有參考文獻、中英文名詞對照和索引.
作者簡介
王建康：中國農業科學院杰出人才二級學科帶頭人、研究員、博導。入選“新世紀百千萬人才工程”國家級人選。從事應用數量遺傳的教學和研究工作。主持或參加國家973計劃、863計劃、國家自然科學基金等科研項目。
目次
前言
第1章 遺傳研究群體
1.1 遺傳研究的常見群體類型
1.1.1 雙親群體
1.1.2 多親群體
1.1.3 創建遺傳群體的若干注意事項
1.2 基因型數據的初步整理和分析
1.2.1 基因型數據的獲取
1.2.2 基因頻率和基因型頻率
1.2.3 基因型頻率的適合性檢驗
l.3 基因效應和遺傳方差
1.3.1 群體均值和表型方差的計算
1.3.2 單基因座位上的加顯性遺傳模型
1.3.3 單基因座位上的遺傳方差
1.4 單環境表型觀測值的方差分析 前言
第1章 遺傳研究群體
1.1 遺傳研究的常見群體類型
1.1.1 雙親群體
1.1.2 多親群體
1.1.3 創建遺傳群體的若干注意事項
1.2 基因型數據的初步整理和分析
1.2.1 基因型數據的獲取
1.2.2 基因頻率和基因型頻率
1.2.3 基因型頻率的適合性檢驗
l.3 基因效應和遺傳方差
1.3.1 群體均值和表型方差的計算
1.3.2 單基因座位上的加顯性遺傳模型
1.3.3 單基因座位上的遺傳方差
1.4 單環境表型觀測值的方差分析
1.4.1 表型值的線性分解
1.4.2 表型離差平方和的分解
1.4.3 水稻粒長性狀的單環境方差分析
1.5 多環境表型觀測值的方差分析
1.5.1 表型值的線性分解
1.5.2 表型離差平方和的分解
1.5.3 水稻粒長的多環境方差分析
1.6 基因型值和遺傳力的估計
1.6.1 單環境基因型值和遺傳力的估計
1.6.2 多環境基因型值和遺傳力的估計
1.6.3 異質誤差方差下基因型值的估計
練習題
第2章 連鎖分析和遺傳圖譜構建
2.1 世代轉移矩陣
2.1.1 世代轉移矩陣的定義
2.1.2 回交世代轉移矩陣
2.1.3 自交世代轉移矩陣
2.1.4 加倍單倍體世代轉移矩陣
2.1.5 連續自交的世代轉移矩陣
2.1.6 基因型理論頻率的矩陣表示
§2.2 兩個座位上各種基因型的理論頻率
2.2.1 10種基因型的理論頻率
2.2.2 永久群體中4種純合基因型的理論頻率
2.2.3 兩個共顯性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
2.2.4 一個共顯性和一個顯性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
2.2.5 一個共顯性和一個隱性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
2.2.6 兩個顯性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
2.2.7 一個顯性和一個隱性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
2.2.8 兩個隱性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
§2.3 兩個標記／基因座位間重組率的估算一
2.3.1 DH群體中重組率的極大似然估計
2.3.2 重組率極大似然估計的一般形式
2.3.3 F2群體中一個共顯性座位和一個顯性座位間的重組率估計
2.3.4 Newton迭代算法中初始值的選取
2.3.5 F2群體中重組率估計的EM算法
2.3.6 奇異分離對重組率估計的影響
2.4 不同遺傳群體重組率估計的比較研究
2.4.1 不同遺傳群體中檢驗連鎖的LOD統計量
2.4.2 不同遺傳群體中重組率估計的準確度
2.4.3 不同遺傳群體檢測到顯著連鎖所需的樣本量
2.5 作圖函數和遺傳圖譜構建
2.5.1 遺傳干涉和干涉系數
2.5.2 作圖函數
2.5.3 標記分群算法
2.5.4 標記排序算法
2.6 隨機交配群體的連鎖分析
2.6.1 隨機交配與連鎖不平衡
2.6.2 基因型到配子的轉移矩陣
2.6.3 隨機交配若干代的配子型和基因型頻率
練習題
第3章 單標記分析和簡單區間作圖
3.1 單標記分析
3.1.1 單標記基因型均值的差異分析
……
第4章 完備區間作圖方法
第5章 互作QTL作圖
第6章 其他類型群體的基因定位
第7章 QTL作圖中的其他常見問題
第8章 育種過程的建模和模擬
第9章 育種方法的模擬和比較
第10章 育種中的預測和設計
參考文獻
中英文名詞對照和索引
圖版
第1章 遺傳研究群體
1.1 遺傳研究的常見群體類型
1.1.1 雙親群體
1.1.2 多親群體
1.1.3 創建遺傳群體的若干注意事項
1.2 基因型數據的初步整理和分析
1.2.1 基因型數據的獲取
1.2.2 基因頻率和基因型頻率
1.2.3 基因型頻率的適合性檢驗
l.3 基因效應和遺傳方差
1.3.1 群體均值和表型方差的計算
1.3.2 單基因座位上的加顯性遺傳模型
1.3.3 單基因座位上的遺傳方差
1.4 單環境表型觀測值的方差分析 前言
第1章 遺傳研究群體
1.1 遺傳研究的常見群體類型
1.1.1 雙親群體
1.1.2 多親群體
1.1.3 創建遺傳群體的若干注意事項
1.2 基因型數據的初步整理和分析
1.2.1 基因型數據的獲取
1.2.2 基因頻率和基因型頻率
1.2.3 基因型頻率的適合性檢驗
l.3 基因效應和遺傳方差
1.3.1 群體均值和表型方差的計算
1.3.2 單基因座位上的加顯性遺傳模型
1.3.3 單基因座位上的遺傳方差
1.4 單環境表型觀測值的方差分析
1.4.1 表型值的線性分解
1.4.2 表型離差平方和的分解
1.4.3 水稻粒長性狀的單環境方差分析
1.5 多環境表型觀測值的方差分析
1.5.1 表型值的線性分解
1.5.2 表型離差平方和的分解
1.5.3 水稻粒長的多環境方差分析
1.6 基因型值和遺傳力的估計
1.6.1 單環境基因型值和遺傳力的估計
1.6.2 多環境基因型值和遺傳力的估計
1.6.3 異質誤差方差下基因型值的估計
練習題
第2章 連鎖分析和遺傳圖譜構建
2.1 世代轉移矩陣
2.1.1 世代轉移矩陣的定義
2.1.2 回交世代轉移矩陣
2.1.3 自交世代轉移矩陣
2.1.4 加倍單倍體世代轉移矩陣
2.1.5 連續自交的世代轉移矩陣
2.1.6 基因型理論頻率的矩陣表示
§2.2 兩個座位上各種基因型的理論頻率
2.2.1 10種基因型的理論頻率
2.2.2 永久群體中4種純合基因型的理論頻率
2.2.3 兩個共顯性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
2.2.4 一個共顯性和一個顯性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
2.2.5 一個共顯性和一個隱性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
2.2.6 兩個顯性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
2.2.7 一個顯性和一個隱性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
2.2.8 兩個隱性標記在暫時群體中的基因型理論頻率
§2.3 兩個標記／基因座位間重組率的估算一
2.3.1 DH群體中重組率的極大似然估計
2.3.2 重組率極大似然估計的一般形式
2.3.3 F2群體中一個共顯性座位和一個顯性座位間的重組率估計
2.3.4 Newton迭代算法中初始值的選取
2.3.5 F2群體中重組率估計的EM算法
2.3.6 奇異分離對重組率估計的影響
2.4 不同遺傳群體重組率估計的比較研究
2.4.1 不同遺傳群體中檢驗連鎖的LOD統計量
2.4.2 不同遺傳群體中重組率估計的準確度
2.4.3 不同遺傳群體檢測到顯著連鎖所需的樣本量
2.5 作圖函數和遺傳圖譜構建
2.5.1 遺傳干涉和干涉系數
2.5.2 作圖函數
2.5.3 標記分群算法
2.5.4 標記排序算法
2.6 隨機交配群體的連鎖分析
2.6.1 隨機交配與連鎖不平衡
2.6.2 基因型到配子的轉移矩陣
2.6.3 隨機交配若干代的配子型和基因型頻率
練習題
第3章 單標記分析和簡單區間作圖
3.1 單標記分析
3.1.1 單標記基因型均值的差異分析
……
第4章 完備區間作圖方法
第5章 互作QTL作圖
第6章 其他類型群體的基因定位
第7章 QTL作圖中的其他常見問題
第8章 育種過程的建模和模擬
第9章 育種方法的模擬和比較
第10章 育種中的預測和設計
參考文獻
中英文名詞對照和索引
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