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《第二代測序信息處理》幾乎涵蓋了NGS 技術在生命科學領域的全部應用，包括從頭測序（含基因組注釋）、針對稀有變異檢測和元基因組研究的擴增子測序、染色質免疫共沉淀測序（ChIP-seq）、RNA 測序（RNA-seq）和腫瘤體細胞變異檢測（包括單堿基替換、插入、缺失和易位）等。通過廣泛使用的一線軟件充分討論數據分析方法，詳述最優工作流程（包括部分學習指南），實用性強、可靠性強、專業指導性強。
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《第二代測序信息處理》以30 多個美國國立衛生研究院資助項目的大量經驗為基礎，綜合本領域著作并去粗取精，為讀者提供了多種NGS 研究的全景展示，通過廣泛使用的軟件討論數據分析方法，詳述最優工作流程（包括部分學習指南）。
目次
譯者前言
前言
1 DNA測序簡介 Stuart M. Brown
2 測序信息學的歷史 Stuart M. Brown
3 第二代測序數據的可視化
Phillip Ross Smith，Kranti Konganti和Stuart M. Brown
4 DNA序列比對 Efstratios Efstathiadis
5 用廣義de Bruijn有向圖算法組裝基因組 D. Frank Hsu
6 用短序列讀段從頭組裝細菌基因組 Silvia Argimon和Stuart M. Brown
7 基因組注釋 Steven Shen
8 使用第二代測序技術檢測序列變異
Jinhua Wang，Zuojian Tang和Stuart M. Brown
9 ChIP-seq
Zuojian Tang，Christina Schweikert，D. Frank Hsu和Stuart M. Brown
10 使用第二代測序進行RNA測序 譯者前言
前言
1 DNA測序簡介 Stuart M. Brown
2 測序信息學的歷史 Stuart M. Brown
3 第二代測序數據的可視化
Phillip Ross Smith，Kranti Konganti和Stuart M. Brown
4 DNA序列比對 Efstratios Efstathiadis
5 用廣義de Bruijn有向圖算法組裝基因組 D. Frank Hsu
6 用短序列讀段從頭組裝細菌基因組 Silvia Argimon和Stuart M. Brown
7 基因組注釋 Steven Shen
8 使用第二代測序技術檢測序列變異
Jinhua Wang，Zuojian Tang和Stuart M. Brown
9 ChIP-seq
Zuojian Tang，Christina Schweikert，D. Frank Hsu和Stuart M. Brown
10 使用第二代測序進行RNA測序
Stuart M. Brown，Jeremy Goecks 和James Taylor
11 元基因組學 Alexander Alekseyenko和Stuart M. Brown
12 DNA測序信息學中的高性能計算 Efstratios Efstathiadis和Eric R. Peskin
術語表
索引
彩圖
前言
1 DNA測序簡介 Stuart M. Brown
2 測序信息學的歷史 Stuart M. Brown
3 第二代測序數據的可視化
Phillip Ross Smith，Kranti Konganti和Stuart M. Brown
4 DNA序列比對 Efstratios Efstathiadis
5 用廣義de Bruijn有向圖算法組裝基因組 D. Frank Hsu
6 用短序列讀段從頭組裝細菌基因組 Silvia Argimon和Stuart M. Brown
7 基因組注釋 Steven Shen
8 使用第二代測序技術檢測序列變異
Jinhua Wang，Zuojian Tang和Stuart M. Brown
9 ChIP-seq
Zuojian Tang，Christina Schweikert，D. Frank Hsu和Stuart M. Brown
10 使用第二代測序進行RNA測序 譯者前言
前言
1 DNA測序簡介 Stuart M. Brown
2 測序信息學的歷史 Stuart M. Brown
3 第二代測序數據的可視化
Phillip Ross Smith，Kranti Konganti和Stuart M. Brown
4 DNA序列比對 Efstratios Efstathiadis
5 用廣義de Bruijn有向圖算法組裝基因組 D. Frank Hsu
6 用短序列讀段從頭組裝細菌基因組 Silvia Argimon和Stuart M. Brown
7 基因組注釋 Steven Shen
8 使用第二代測序技術檢測序列變異
Jinhua Wang，Zuojian Tang和Stuart M. Brown
9 ChIP-seq
Zuojian Tang，Christina Schweikert，D. Frank Hsu和Stuart M. Brown
10 使用第二代測序進行RNA測序
Stuart M. Brown，Jeremy Goecks 和James Taylor
11 元基因組學 Alexander Alekseyenko和Stuart M. Brown
12 DNA測序信息學中的高性能計算 Efstratios Efstathiadis和Eric R. Peskin
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