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目次
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《酵母細胞凋亡》介紹了酵母細胞凋亡的研究歷史、研究方法；論述了影響酵母細胞凋亡的外界因素和胞內調控機制，同時著重介紹細胞器與酵母細胞凋亡之間的關係以及自由基調控酵母細胞凋亡的機制，並對檸檬酸鈉和葡萄糖誘導酵母細胞凋亡的機理進行總結；對酵母細胞凋亡在衰老、壽命以及人類疾病方面的應用做了系統的闡述。書後附有酵母細胞凋亡常用名詞英漢對照、名詞縮寫、索引等，以便讀者學習。
目次
目錄
第1章 緒論 1
1.1 細胞死亡方式 1
1.1.1 細胞死亡 1
1.1.2 細胞凋亡 4
1.1.3 細胞自噬 5
1.1.4 細胞壞死 7
1.1.5 細胞焦亡 8
1.2 酵母細胞凋亡 10
1.2.1 酵母細胞凋亡的研究歷史 10
1.2.2 酵母細胞凋亡與動物細胞凋亡的聯繫 11
1.3 酵母細胞凋亡的研究進展 13
1.3.1 酵母細胞凋亡的研究文獻分析 14
1.3.2 國內外對酵母細胞凋亡的研究分析 15
參考文獻 18
第2章 酵母細胞凋亡的研究方法 23
2.1 形態學特徵 23
2.1.1 光學顯微鏡 24
2.1.2 電子顯微鏡 28
2.2 生化特徵 31
2.2.1 DNA降解分析 31
2.2.2 細胞凋亡相關蛋白質分析 34
2.2.3 流式細胞術分析 39
2.3 代謝特徵 42
2.3.1 線粒體膜電位分析 42
2.3.2 系統生物學分析 43
2.4 總結 48
參考文獻 50
第3章 酵母細胞凋亡的調控因素 54
3.1 酵母細胞凋亡的誘導因素 54
3.1.1 環境因素 54
3.1.2 化學物質 57
3.1.3 金屬元素 63
3.1.4 激素 65
3.1.5 藥物誘導 66
3.1.6 異源促凋亡基因表達 69
3.2 酵母細胞凋亡的抑制因素 73
3.2.1 凋亡抑制蛋白 73
3.2.2 Bax抑制劑-1 74
3.2.3 鳥苷三磷酸（GTP）結合蛋白 75
3.2.4 核糖體蛋白 75
3.2.5 左旋肉堿 76
參考文獻 76
第4章 酵母細胞凋亡的調控機制 88
4.1 半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶途徑 88
4.1.1 半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶信號通路概述 88
4.1.2 酵母半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶 89
4.2 絲裂原激活蛋白激酶與酵母細胞凋亡 93
4.2.1 酵母細胞中的MAPK途徑 94
4.2.2 信息素應答途徑 95
4.2.3 絲狀侵入生長途徑 97
4.2.4 酵母高滲透壓甘油途徑 98
4.2.5 細胞壁完整性途徑 100
4.2.6 孢子壁裝配途徑 101
4.2.7 MAPK對酵母細胞凋亡的影響 102
4.3 Bcl-2家族與酵母細胞凋亡 104
4.3.1 Bcl-2家族 104
4.3.2 Fis1p 105
4.3.3 Ybh3p 106
4.4 蛋白激酶A與酵母細胞凋亡 107
4.4.1 Ras/cAMP/PKA信號通路概述 107
4.4.2 Ras/cAMP/PKA途徑相關調控因子 108
4.5 pH與酵母細胞凋亡 120
4.5.1 V-ATPase 121
4.5.2 Pma1p 122
4.5.3 PKA/TORC1/Sch9信號系統調控pH 122
4.6 鈣離子與細胞凋亡 124
4.7 酵母細胞凋亡的其他調控因子 128
4.7.1 Nuc1p 128
4.7.2 Bir1p 129
4.7.3 Aif1p 130
4.7.4 Tps1p 131
4.7.5 Kex1p 132
參考文獻 132
第5章 細胞器與酵母細胞凋亡 145
5.1 線粒體與酵母細胞凋亡 145
5.1.1 線粒體膜透性與酵母細胞凋亡 145
5.1.2 線粒體融合和分裂與酵母細胞凋亡 147
5.1.3 線粒體Cyt c釋放與酵母細胞凋亡 150
5.1.4 酵母細胞凋亡與線粒體功能突變體 151
5.2 液泡與酵母細胞凋亡 152
5.3 內質網與酵母細胞凋亡 153
5.4 細胞核與酵母細胞凋亡 155
5.4.1 酵母細胞凋亡與DNA損傷 155
5.4.2 酵母細胞凋亡與mRNA的穩定性 156
5.4.3 酵母細胞凋亡與染色質改變 158
5.5 線粒體與其他細胞器的相互作用 159
5.5.1 線粒體與內質網之間的相互作用 159
5.5.2 線粒體與細胞核之間的相互作用 160
5.5.3 線粒體與液泡之間的相互作用 162
參考文獻 163
第6章 自由基與酵母細胞凋亡 171
6.1 自由基簡介 171
6.1.1 自由基定義與分類 171
6.1.2 自由基對生物大分子的作用 171
6.2 ROS與細胞凋亡 173
6.2.1 ROS的簡介 173
6.2.2 ROS的合成與降解 174
6.2.3 ROS的功能 176
6.2.4 ROS對細胞凋亡的調控機制 179
6.3 活性氮與細胞凋亡 186
6.3.1 活性氮定義 186
6.3.2 NO的合成與降解 186
6.3.3 NO與酵母細胞凋亡的關係 188
6.3.4 NO介導的酵母細胞凋亡途徑 190
參考文獻 191
第7章 酵母細胞凋亡的應用 198
7.1 酵母細胞凋亡與衰老 198
7.1.1 機體衰老與細胞衰老 198
7.1.2 酵母細胞衰老 199
7.1.3 衰老與細胞凋亡 200
7.1.4 衰老與酵母細胞凋亡 200
7.2 酵母細胞凋亡與壽命 203
7.2.1 酵母細胞壽命 203
7.2.2 熱量和營養限制與酵母細胞凋亡 204
7.2.3 酵母細胞模型在壽命研究中的應用 206
7.3 酵母細胞凋亡與代謝綜合征 207
7.3.1 酵母細胞凋亡與脂代謝 208
7.3.2 酵母細胞凋亡與糖尿病 210
7.4 酵母細胞凋亡與神經退行性疾病 211
7.4.1 神經退行性疾病特徵和病理機制 211
7.4.2 從酵母理解人類神經退行性疾病 213
7.4.3 酵母細胞在AD研究中的應用 213
7.4.4 酵母細胞在PD研究中的應用 215
7.4.5 酵母細胞在HD研究中的應用 220
7.4.6 酵母細胞在朊病毒研究中的應用 221
7.4.7 酵母細胞在其他神經退行性疾病研究中的應用 222
7.5 酵母細胞凋亡與癌症 223
7.5.1 癌症發生機制與酵母細胞凋亡 223
7.5.2 癌症治療與酵母細胞凋亡 224
7.5.3 酵母細胞模型在癌症研究中的應用 225
7.6 酵母細胞凋亡與藥物開發 230
7.6.1 基於酵母細胞模型的藥物篩選策略 230
7.6.2 酵母細胞模型在藥物發現中的應用 235
參考文獻 236
第8章 檸檬酸鈉與酵母細胞凋亡 250
8.1 檸檬酸鈉誘導酵母細胞生活力喪失的特性研究 251
8.1.1 檸檬酸鈉誘導酵母細胞凋亡的形態學特徵 251
8.1.2 檸檬酸鈉誘導酵母細胞凋亡具有菌株特異性 254
8.2 檸檬酸鈉誘導酵母細胞凋亡的活性氧作用機制 260
8.2.1 檸檬酸鈉誘導酵母細胞凋亡過程中的活性氧變化規律 260
8.2.2 抗氧化劑對檸檬酸鈉誘導酵母細胞生活力的影響 262
8.3 檸檬酸鈉誘導酵母細胞生活力喪失的效應因子解析 262
8.3.1 檸檬酸鈉對酵母細胞生活力影響的效應因子探討 262
8.3.2 外源組分對檸檬酸鈉誘導酵母細胞生活力喪失的影響 264
8.3.3 檸檬酸鈉對酵母細胞碳源代謝指紋圖譜的影響 269
8.3.4 小結 271
8.4 檸檬酸鈉誘導酵母生活力喪失的cAMP/cGMP信號通路解析 271
8.4.1 ATP對檸檬酸鈉調控的酵母細胞生活力影響的分析 274
8.4.2 cAMP對檸檬酸鈉調控的酵母細胞生活力影響的分析 275
8.4.3 cGMP對檸檬酸鈉調控的酵母細胞生活力影響的分析 277
8.4.4 SNAP對檸檬酸鈉調控的酵母細胞生活力影響的分析 277
8.4.5 PTIO對檸檬酸鈉調控的酵母細胞生活力影響的分析 277
8.4.6 L-Arg對檸檬酸鈉調控的酵母細胞生活力影響的分析 280
8.4.7 L-Cit對檸檬酸鈉調控的酵母細胞生活力影響的分析 282
8.4.8 SNAP、cAMP、ATP、L-Arg、L-Cit以及PTIO的組合效應 283
8.4.9 小結 286
8.5 檸檬酸鈉誘導酵母細胞生活力喪失的轉錄組學 286
8.5.1 檸檬酸鈉誘導的酵母細胞轉錄組測序分析 287
8.5.2 Unigene差異表達分析 288
8.6 總結 290
參考文獻 291
第9章 葡萄糖與酵母細胞凋亡 295
9.1 葡萄糖誘導釀酒酵母生活力喪失的特性研究 295
9.1.1 酵母細胞不同生長階段對糖誘導的效應 296
9.1.2 葡萄糖濃度的影響 300
9.1.3 葡萄糖對釀酒酵母碳源代謝指紋圖譜的影響 305
9.1.4 小結 307
9.2 葡萄糖誘導釀酒酵母生活力喪失中氮源因子調控機理 307
9.2.1 不同氮源對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 308
9.2.2 小結 312
9.3 葡萄糖誘導釀酒酵母生活力喪失的cAMP/cGMP信號通路解析 312
9.3.1 cAMP對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 313
9.3.2 cGMP對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 314
9.3.3 SNAP對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 316
9.3.4 PTIO對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 316
9.3.5 L-Arg對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 319
9.3.6 L-Cit對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 320
9.3.7 小結 322
9.4 葡萄糖誘導釀酒酵母生活力喪失的能量守恆通路解析 323
9.4.1 ATP對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 324
9.4.2 AMP對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響325
9.4.3 NADH對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 327
9.4.4 NADP對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 328
9.4.5 小結 330
參考文獻 330
中英文對照 332
索引 338
彩圖 341
第1章 緒論 1
1.1 細胞死亡方式 1
1.1.1 細胞死亡 1
1.1.2 細胞凋亡 4
1.1.3 細胞自噬 5
1.1.4 細胞壞死 7
1.1.5 細胞焦亡 8
1.2 酵母細胞凋亡 10
1.2.1 酵母細胞凋亡的研究歷史 10
1.2.2 酵母細胞凋亡與動物細胞凋亡的聯繫 11
1.3 酵母細胞凋亡的研究進展 13
1.3.1 酵母細胞凋亡的研究文獻分析 14
1.3.2 國內外對酵母細胞凋亡的研究分析 15
參考文獻 18
第2章 酵母細胞凋亡的研究方法 23
2.1 形態學特徵 23
2.1.1 光學顯微鏡 24
2.1.2 電子顯微鏡 28
2.2 生化特徵 31
2.2.1 DNA降解分析 31
2.2.2 細胞凋亡相關蛋白質分析 34
2.2.3 流式細胞術分析 39
2.3 代謝特徵 42
2.3.1 線粒體膜電位分析 42
2.3.2 系統生物學分析 43
2.4 總結 48
參考文獻 50
第3章 酵母細胞凋亡的調控因素 54
3.1 酵母細胞凋亡的誘導因素 54
3.1.1 環境因素 54
3.1.2 化學物質 57
3.1.3 金屬元素 63
3.1.4 激素 65
3.1.5 藥物誘導 66
3.1.6 異源促凋亡基因表達 69
3.2 酵母細胞凋亡的抑制因素 73
3.2.1 凋亡抑制蛋白 73
3.2.2 Bax抑制劑-1 74
3.2.3 鳥苷三磷酸（GTP）結合蛋白 75
3.2.4 核糖體蛋白 75
3.2.5 左旋肉堿 76
參考文獻 76
第4章 酵母細胞凋亡的調控機制 88
4.1 半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶途徑 88
4.1.1 半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶信號通路概述 88
4.1.2 酵母半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶 89
4.2 絲裂原激活蛋白激酶與酵母細胞凋亡 93
4.2.1 酵母細胞中的MAPK途徑 94
4.2.2 信息素應答途徑 95
4.2.3 絲狀侵入生長途徑 97
4.2.4 酵母高滲透壓甘油途徑 98
4.2.5 細胞壁完整性途徑 100
4.2.6 孢子壁裝配途徑 101
4.2.7 MAPK對酵母細胞凋亡的影響 102
4.3 Bcl-2家族與酵母細胞凋亡 104
4.3.1 Bcl-2家族 104
4.3.2 Fis1p 105
4.3.3 Ybh3p 106
4.4 蛋白激酶A與酵母細胞凋亡 107
4.4.1 Ras/cAMP/PKA信號通路概述 107
4.4.2 Ras/cAMP/PKA途徑相關調控因子 108
4.5 pH與酵母細胞凋亡 120
4.5.1 V-ATPase 121
4.5.2 Pma1p 122
4.5.3 PKA/TORC1/Sch9信號系統調控pH 122
4.6 鈣離子與細胞凋亡 124
4.7 酵母細胞凋亡的其他調控因子 128
4.7.1 Nuc1p 128
4.7.2 Bir1p 129
4.7.3 Aif1p 130
4.7.4 Tps1p 131
4.7.5 Kex1p 132
參考文獻 132
第5章 細胞器與酵母細胞凋亡 145
5.1 線粒體與酵母細胞凋亡 145
5.1.1 線粒體膜透性與酵母細胞凋亡 145
5.1.2 線粒體融合和分裂與酵母細胞凋亡 147
5.1.3 線粒體Cyt c釋放與酵母細胞凋亡 150
5.1.4 酵母細胞凋亡與線粒體功能突變體 151
5.2 液泡與酵母細胞凋亡 152
5.3 內質網與酵母細胞凋亡 153
5.4 細胞核與酵母細胞凋亡 155
5.4.1 酵母細胞凋亡與DNA損傷 155
5.4.2 酵母細胞凋亡與mRNA的穩定性 156
5.4.3 酵母細胞凋亡與染色質改變 158
5.5 線粒體與其他細胞器的相互作用 159
5.5.1 線粒體與內質網之間的相互作用 159
5.5.2 線粒體與細胞核之間的相互作用 160
5.5.3 線粒體與液泡之間的相互作用 162
參考文獻 163
第6章 自由基與酵母細胞凋亡 171
6.1 自由基簡介 171
6.1.1 自由基定義與分類 171
6.1.2 自由基對生物大分子的作用 171
6.2 ROS與細胞凋亡 173
6.2.1 ROS的簡介 173
6.2.2 ROS的合成與降解 174
6.2.3 ROS的功能 176
6.2.4 ROS對細胞凋亡的調控機制 179
6.3 活性氮與細胞凋亡 186
6.3.1 活性氮定義 186
6.3.2 NO的合成與降解 186
6.3.3 NO與酵母細胞凋亡的關係 188
6.3.4 NO介導的酵母細胞凋亡途徑 190
參考文獻 191
第7章 酵母細胞凋亡的應用 198
7.1 酵母細胞凋亡與衰老 198
7.1.1 機體衰老與細胞衰老 198
7.1.2 酵母細胞衰老 199
7.1.3 衰老與細胞凋亡 200
7.1.4 衰老與酵母細胞凋亡 200
7.2 酵母細胞凋亡與壽命 203
7.2.1 酵母細胞壽命 203
7.2.2 熱量和營養限制與酵母細胞凋亡 204
7.2.3 酵母細胞模型在壽命研究中的應用 206
7.3 酵母細胞凋亡與代謝綜合征 207
7.3.1 酵母細胞凋亡與脂代謝 208
7.3.2 酵母細胞凋亡與糖尿病 210
7.4 酵母細胞凋亡與神經退行性疾病 211
7.4.1 神經退行性疾病特徵和病理機制 211
7.4.2 從酵母理解人類神經退行性疾病 213
7.4.3 酵母細胞在AD研究中的應用 213
7.4.4 酵母細胞在PD研究中的應用 215
7.4.5 酵母細胞在HD研究中的應用 220
7.4.6 酵母細胞在朊病毒研究中的應用 221
7.4.7 酵母細胞在其他神經退行性疾病研究中的應用 222
7.5 酵母細胞凋亡與癌症 223
7.5.1 癌症發生機制與酵母細胞凋亡 223
7.5.2 癌症治療與酵母細胞凋亡 224
7.5.3 酵母細胞模型在癌症研究中的應用 225
7.6 酵母細胞凋亡與藥物開發 230
7.6.1 基於酵母細胞模型的藥物篩選策略 230
7.6.2 酵母細胞模型在藥物發現中的應用 235
參考文獻 236
第8章 檸檬酸鈉與酵母細胞凋亡 250
8.1 檸檬酸鈉誘導酵母細胞生活力喪失的特性研究 251
8.1.1 檸檬酸鈉誘導酵母細胞凋亡的形態學特徵 251
8.1.2 檸檬酸鈉誘導酵母細胞凋亡具有菌株特異性 254
8.2 檸檬酸鈉誘導酵母細胞凋亡的活性氧作用機制 260
8.2.1 檸檬酸鈉誘導酵母細胞凋亡過程中的活性氧變化規律 260
8.2.2 抗氧化劑對檸檬酸鈉誘導酵母細胞生活力的影響 262
8.3 檸檬酸鈉誘導酵母細胞生活力喪失的效應因子解析 262
8.3.1 檸檬酸鈉對酵母細胞生活力影響的效應因子探討 262
8.3.2 外源組分對檸檬酸鈉誘導酵母細胞生活力喪失的影響 264
8.3.3 檸檬酸鈉對酵母細胞碳源代謝指紋圖譜的影響 269
8.3.4 小結 271
8.4 檸檬酸鈉誘導酵母生活力喪失的cAMP/cGMP信號通路解析 271
8.4.1 ATP對檸檬酸鈉調控的酵母細胞生活力影響的分析 274
8.4.2 cAMP對檸檬酸鈉調控的酵母細胞生活力影響的分析 275
8.4.3 cGMP對檸檬酸鈉調控的酵母細胞生活力影響的分析 277
8.4.4 SNAP對檸檬酸鈉調控的酵母細胞生活力影響的分析 277
8.4.5 PTIO對檸檬酸鈉調控的酵母細胞生活力影響的分析 277
8.4.6 L-Arg對檸檬酸鈉調控的酵母細胞生活力影響的分析 280
8.4.7 L-Cit對檸檬酸鈉調控的酵母細胞生活力影響的分析 282
8.4.8 SNAP、cAMP、ATP、L-Arg、L-Cit以及PTIO的組合效應 283
8.4.9 小結 286
8.5 檸檬酸鈉誘導酵母細胞生活力喪失的轉錄組學 286
8.5.1 檸檬酸鈉誘導的酵母細胞轉錄組測序分析 287
8.5.2 Unigene差異表達分析 288
8.6 總結 290
參考文獻 291
第9章 葡萄糖與酵母細胞凋亡 295
9.1 葡萄糖誘導釀酒酵母生活力喪失的特性研究 295
9.1.1 酵母細胞不同生長階段對糖誘導的效應 296
9.1.2 葡萄糖濃度的影響 300
9.1.3 葡萄糖對釀酒酵母碳源代謝指紋圖譜的影響 305
9.1.4 小結 307
9.2 葡萄糖誘導釀酒酵母生活力喪失中氮源因子調控機理 307
9.2.1 不同氮源對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 308
9.2.2 小結 312
9.3 葡萄糖誘導釀酒酵母生活力喪失的cAMP/cGMP信號通路解析 312
9.3.1 cAMP對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 313
9.3.2 cGMP對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 314
9.3.3 SNAP對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 316
9.3.4 PTIO對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 316
9.3.5 L-Arg對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 319
9.3.6 L-Cit對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 320
9.3.7 小結 322
9.4 葡萄糖誘導釀酒酵母生活力喪失的能量守恆通路解析 323
9.4.1 ATP對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 324
9.4.2 AMP對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響325
9.4.3 NADH對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 327
9.4.4 NADP對葡萄糖誘導釀酒酵母生活力的影響 328
9.4.5 小結 330
參考文獻 330
中英文對照 332
索引 338
彩圖 341
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