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本所自94年初起進行第3期5年商港整體發展規劃，本研究針對未完整部份，包括：港埠政策形成所應考量之因素，臺灣地區各類商港設立準則，國內商港發展政策，漁港交通船碼頭政策，港區親水遊憩空間規劃之探討。
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臺灣港口雖未遭遇如日本阪神地震神戶港全面性之災害，但局部性之災害亦曾發生，相關案例包括民國75年花蓮地震造成蘇澳港部份碼頭側移，及花蓮港新建碼頭後線背填土沉陷，與民國88年921地震造成臺中港部份碼頭區之土壤液化，所以，港灣地震災害事件極容易發生。過去港灣地震災害之處置，主要係於災情發生後，才進行事後調查、災害原因診斷與災後復建，因而極易延誤處理作業，影響港口正常營運；更由於缺少災害發生時之監測資
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港灣及海岸地區之結構物常採用樁基礎設計，進行考慮土壤－樁基礎－上部結構系統於液化前後之動態互制分析為進行結構設計、安全評估及研擬防制對策之要件。本計畫將進行考慮土壤非線性與孔隙水壓激發行為且可模擬基樁與上部結構之有效應力動態分析，由數值分析結果規劃以進行大尺寸地表震源重模試坑基樁液化試驗，由量測之基樁動態反應與土壤震動與孔隙水壓力耦合行為，率定數值分析結果，經驗正後之數值程序，將應用於分析棧橋式碼
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自從921集集大地震發生後，地震相關的研究甚受各界重視；2005年南亞海嘯造成的重大傷亡，讓國人在心驚之餘，更進一步正視地震與海嘯可能造成的威脅。由於港灣地區之地質多屬疏鬆軟弱之沖積土層及海埔新生地，在強烈地震作用下，可能發生液化現象，造成港灣碼頭災害，另根據歷史與地方誌記載，高雄、安平與基隆亦曾發生大海嘯，因此近岸及港灣地區地震與海嘯之影響研究，極為重要；地震既難以預測，震波傳遞速度之快也令人難
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臺灣目前有四個國際商港及其輔助港，每個港在港埠的創建及長期的維護下，都累積了相當龐大的工程資料，本中心已利用地理資訊系統工具，將其中四個主要港口的碼頭、地質等資料加以數化建檔，且製作成查詢系統。本計畫規劃於今後兩年內，邀集本中心各研究群參與資料之收集及建置，繼續整補相關資料，並利用程式語言建立查詢管理流程，建置各分港及輔助港的查詢內容，另外針對台灣港埠所曾遭受的重大破壞，如颱風、地震等特定災損情形
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本所自94年初起進行第3期5年商港整體發展規劃，限於時間無法比照國際商港全面深入探討，本案針對國內海運發展課題作深入廣泛之探討。
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