Melhoramento molecular e recursos genéticos do arroz Tulaipanji

Este livro trata dos v嫫ios aspectos da varia誽o de SNPs/Indels nas linhas de descend瘽cia (Tulaipanji x Ranjit) e dos recursos gen彋icos do arroz selvagem Oryza rufipogon. Os germoplasmas de arroz foram descritos com base em propriedades morfo-f疄ico-qu璥icas, an嫮ise GCMS, SEM de gr緌s e gr滱ulos de amido. A tecnologia TILLING/Eco-TILLING baseada na gen彋ica inversa foi ilustrada para a extra誽o de alelos. O m彋odo GBS baseado em NGS (Illumina) foi utilizado neste estudo para analisar as varia踥es SNP e InDel e o seu padr緌 de introgress緌 nas linhas de descend瘽cia F5 (P-awn e P-awnless). O nero total de SNPs identificados foi de 52.810 e de Indels 4327. Estas variantes n緌 estavam distribu獮as uniformemente pelos 12 cromossomas (com base no Golden Helix G Browser). O estudo demonstrou que, de um total de 10013 alelos, 92,52% foram introduzidos em P-awn a partir de Tulaipanji e 7,485 a partir de Ranjit; em contrapartida, P-awnless transportou 89,19% de Ranjit e 10,81% de Tulaipanji. Isto deve-se ?distor誽o da segrega誽o. Muitas varia踥es SNP est緌 associadas a caracter疄ticas importantes. Tais como GA20-oxidase (gene sd1), Argonaute e prote璯a Dicer com dom璯io PAZ. Ficheiros Fastq de quatro linhas de arroz com NCBI SRA Accession no. SRP077861, SRP077919, SRP077947 & SRP077977.