Sélection moléculaire et ressources génétiques du riz Tulaipanji

Ce livre traite des divers aspects de la variation des SNP/Indels dans les lign嶪s de descendance (Tulaipanji x Ranjit) et les ressources g幯彋iques du riz sauvage Oryza rufipogon. Les germoplasmes de riz ont 彋?d嶰rits sur la base des propri彋廥 morpho-physicochimiques, de l'analyse GCMS, du MEB des grains et des granules d'amidon. La technologie TILLING/Eco-TILLING bas嶪 sur la g幯彋ique inverse a 彋?illustr嶪 pour l'extraction d'all鋩es. La m彋hode GBS bas嶪 sur la NGS (Illumina) a 彋?employ嶪 dans cette 彋ude pour analyser les variations SNP et InDel et leur sch幦a d'introgression dans les lign嶪s de descendance F5 (P-awn et P-awnless). Le nombre total de SNP identifi廥 彋ait de 52 810 et celui des indels de 4 327. Ces variantes n'彋aient pas r廧arties uniform幦ent sur les 12 chromosomes (d'apr鋊 le Golden Helix G Browser). L'彋ude a montr?que sur un nombre d'all鋩es de 10013, 92,52% ont 彋?introgress廥 dans P-awn ?partir de Tulaipanji et 7,485 ?partir de Ranjit, en revanche, P-awnless a port?89,19% ?partir de Ranjit et 10,81% ?partir de Tulaipanji. Cela est d??une distorsion de la s嶲r嶲ation. De nombreuses variations SNP sont associ嶪s ?des caract鋨es importants. Comme la GA20-oxydase (g鋝e sd1), l'Argonaute et la prot嶯ne Dicer avec le domaine PAZ. Fichiers Fastq de quatre lign嶪s de riz avec NCBI SRA Accession no. SRP077861, SRP077919, SRP077947 & SRP077977.