DNA和蛋白質序列數據分析工具(第二版)（簡體書）

在眾多生物基因組測序項目完成之際，我們面臨的最大挑戰是如何對DNA和蛋白質數據進行科學的分析和注釋。本書分三個層次解讀基因數據庫和網絡工具：基因組學層面重點介紹序列比對工具BLAS丁和CltlstalX的使用、真核生物基因結構的預測、電子克隆及分子進化遺傳分析工具(MEGA 4)的使用；蛋白質組學層面介紹了蛋白質結構與功能預測、序列模體的識別和解析、蛋白質譜數據分析、基因芯片數據處理和分析，以及應用GO注釋基因功能和通過KEGG分析代謝途徑：系統生物學層面從網絡結構分析闡述了蛋白質與蛋白質的相互作用；此外，還增添了使用Bioperl模塊進行數據分析和Windows操作系統下Bioperl程序包的安裝等內容。書中提及的各種方法均有充實的例證并附卜相關數據和圖表，供讀者理解和參考：書后還附有中英文的專業術語和詞匯。
本書可作為對生物信息學專業感興趣的本科生、研究生和研究人員學習、研究的重要工具手冊。

第二版前言
第一版前言
第1章 序列比對工具BLAST和ClustalX的使用
1.1 序列比對BLAST
1.1.1 Basic BLAST
1.1.2 網上blastx比對
1.1.3 網上PSl.Blast比對
L.1.4 Specialized BLAST
1.1.5 網上Blast2比對
1.2 本地運行BLAST(Windows系統)
1.2.1 BLAST程序下載
1.2.2 BLAST程序安裝
1.2.3 進入DOS命令行提示符狀態
1.2.4 搜索數據庫的格式化
1.2.5 BLAST搜索程序運行
1.2.6 本地化BLAST搜索結果查看
1.3 多序列比對(ClustalX)
1.3.1 ClustalX的使用
1.3.2 數據的輸入
1.3.3 數據的輸出
主要參考文獻
第2章 真核生物基因結構的預測
2.1 基因可讀框的識別
2.2 CpG島、轉錄終止信號和啟動子區域的預測
2.2.1 CpG島的預測
2.2.2 轉錄終止信號的預測
2.2.3 啟動子區域的預測
2.3 基因密碼子偏好性計算：CodonW的使用
2.4 采用mRNA序列預測基因：Spidey的使用
2.5 ASTD數據庫簡介
主要參考文獻
第3章 電子克隆
第4章 分子進化遺傳分析工具的使用
第5章 蛋白質結構與功能預測
第6章 序列模體的識別和解析
第7章 蛋白質譜數據分析
第8章 基因芯片數據處理和分析
第9章 應用GO注釋基因功能和通過KEGG分析代謝途徑
第10章 系統生物學網絡結構分析
第11章 使用Bioperl模塊作數據分析
第12章 Winodws環境下Bioperl程序包的安裝
英漢對照詞匯
彩圖